Οι δυο υποπαραλαλγές της μετάλλαξης «Όμικρον» BA.2 και BA.5 φαίνεται να κυριαρχούν σε όλη την Ελλάδα.
Στην παρούσα αναφορά περιλαμβάνονται αποτελέσματα ανάλυσης από το Eθνικό Δίκτυο Γονιδιωματικής Επιτήρησης του κορονοϊού, που λειτουργεί υπό το συντονισμό του ΕΟΔΥ, από 326 δείγματα που έχουν επιλεγεί τυχαιοποιημένα ή στοχευμένα και αφορούν στην περίοδο 06 Ιουνίου 2022 έως 01 Ιουλίου 2022. Από όλα τα δείγματα απομονώθηκε στέλεχος Omicron (B.1.1.529).
Από την έναρξη λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2 μέχρι σήμερα έχουν απομονωθεί 28 διαφορετικά στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος/υπό διερεύνηση/υπό παρακολούθηση ή άλλα στελέχη ενδιαφέροντος του ιού SARS CoV-2 από 56.909 αλληλουχηθέντα δείγματα (56.181 προερχόμενα από εγχώρια κρούσματα και 728 από εισαγόμενα).
Η διαχρονική εξέλιξη της σχετικής συχνότητας των αλληλουχηθέντων δειγμάτων από τυχαία δειγματοληψία (Ν=51.595) ανά είδος στελεχών, μέχρι και την εβδομάδα 24 του 2022 απεικονίζεται στο Διάγραμμα 8, ενώ δίνονται επιπλέον προσωρινά στοιχεία για
τις εβδομάδες 25-26. Στο Διάγραμμα 9 απεικονίζεται η διαχρονική εξέλιξη της σχετικής συχνότητας εμφάνισης των υποπαραλλαγών του στελέχους Omicron. Κατά τη διάρκεια του διμήνου πριν τις 01 Ιουλίου 2022, οι δύο πιο συχνές υπο-παραλλαγές του στελέχους Omicron που απομονώθηκαν από εγχώρια δείγματα από τυχαία δειγματοληψία ήταν το BA.2 με ποσοστό 65,7%,ακολουθούμενο από το BA.5 με ποσοστό 21,9% (Πίνακας 3).
Όσον αφορά τις υπο-παραλλαγές του στελέχους Omicron, η γεωγραφική κατανομή ανά Περιφερειακή Ενότητα παρουσιάζεται στον Πίνακα 4.
Διάγραμμα 8. Σχετική συχνότητα αλληλουχηθέντων δειγμάτων από τυχαία δειγματοληψία ανά είδος στελεχών, ανά 15νθήμερο, από την έναρξη της λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS CoV-2 (Ιανουάριος 2021) έως 03/07/2022.
Διάγραμμα 9. Σχετική συχνότητα αλληλουχηθέντων δειγμάτων από τυχαία δειγματοληψία με απομονωθέν στέλεχος B.1.1.529 (Omicron) ανά υπο-παραλλαγή, ανά 15νθήμερο, έως 03/07/2022
Πίνακας 3. Ποσοστό εγχώριων θετικών δειγμάτων για τις υπο-παραλλαγές του στελέχους B.1.1.529 (Omicron) επί του συνόλου των ελεγχθέντων θετικών δειγμάτων από τυχαία δειγματοληψία, ανά Περιφέρεια για το 15νθήμερο από 06/06/2022 έως 19/06/2022 και για το δίμηνο προ της καταληκτικής ημερομηνίας που καλύπτεται από την παρούσα αναφορά (01 Ιουλίου 2022).
Πίνακας 4. Απόλυτος αριθμός κρουσμάτων (ανεξαρτήτως τρόπου δειγματοληψίας) ανά υπο-παραλλαγή Omicron ανά Περιφερειακή Ενότητα, για το δίμηνο προ της καταληκτικής ημερομηνίας που καλύπτεται από την παρούσα αναφορά (01 Ιουλίου 2022).
